نوع مقاله : بیماری‌شناسی گیاهی

نویسندگان

• پیمان طاهری ¹
• مریم غایب زمهریر ²
• جابر کریمی ¹
• ناصر فرخی ³
• امیر محمد ناجی ¹
• علی علیزاده ²
• حسین غلامپور ¹

¹ گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران

² آزمایشگاه پروکاریوت شناسی، موسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

³ دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی شاهرود

چکیده

بیماری میوه سبز مرکبات از جمله مهم‌ترین بیماری‌های مرکبات در مناطق جنوبی کشور می‌باشد. با توجه به ماهیت بیماری، استفاده از ارقام مقاوم مناسب‌ترین راهکار در جهت مبارزه با این بیماری می‌باشد. در راستای شناسایی مکانیسم مقاومت، در این تحقیق برهمکنش میزبان- پاتوژن در گیاه نسبتاً مقاوم سلطان مرکبات (Citrus grandis) با روش cDNA-AFLP در طی 4 ماه پس از ایجاد آلودگی مورد بررسی قرار گرفت. نتایج بدست آمده حاکی از وجود 25 قطعه پلی مورف از نسخه‌های ژنی موجود در برگ گیاهان مورد مطالعه بود که از این تعداد توالی 16 قطعه شبیه به نسخه‌های میزبان بود و 5 قطعه شباهت به توالی DNA باکتری داشت و 4 قطعه دیگر با توالی‌های ثبت شده در بانک‌های اطلاعاتی ژن شباهتی نداشتند. بیان تعدادی از توالی‌ها به روش Semiquantive RT-PCR به طور کمی ارزیابی شد. نتایج cDNA-AFLP وSemiquantive
RT-PCR نشان داد که بیان بسیاری از ژن‌های سلطان مرکبات در طی آلودگی افزایش یافت. افزایش بیان این ژن‌ها در ارتباط با واکنش‌های مقاومت القایی در گیاه می‌باشد. بنا بر دانش ما، این مطالعه اولین بررسی روی تغییرات بیان ژن‌های سلطان مرکبات و Candidatus Leiberibacter asiaticus است که در طی بیماری اتفاق می‌افتد. نتایج این تحقیق می‌تواند به پیشرفت اطلاعات مولکولی مربوط به روند بیماری و شناسایی ژن‌های دخیل در آن کمک نماید.

کلیدواژه‌ها

• میوه سبز مرکبات
• Candidatus Leiberibacter asiaticus
• cDNA-AFLP
• Citrus grandis

عنوان مقاله [English]

Study of gene expression pattern in Citrus grandis plants infected by Candidatus Liberibacter asiaticus causal agent of citrus greening disease

نویسندگان [English]

• P. TAHERI ¹
• M. GHAYEB ZAMHARIR ²
• J. KARIMI ¹
• N. FARROKHI ³
• A. MOHAMMAD NAJI ¹
• A. ALIZADEH ²
• H. GHOLAMPOUR ¹

چکیده [English]

Citrus greening has been reported from south of Iran in 2007. The molecular basis of compatibility and disease development in this system is poorly understood. We have carried out a cDNA-AFLP analysis to identify resistance genes of Citrus grandis and Candidatus Leiberibacter aciaticus susceptibility genes in late infection development stage. Selective amplifications with 10 primer combinations allowed the visualization of about 25 transcript-derived fragments (TDFs) in inoculated leaves, which were differentially expressed. We sequenced 16 fragments, which were identified as Citrus grandis transcripts after homology searching, while 5 were homologous to sequences in NCBI databases and were attributed to Candidatus Leiberibacter asiaticus. Many Citrus grandis genes spanning almost all functional categories were upregulated during infection. This study provides the first global catalogue of Citrus grandis and Candidatus Leiberibacter asiaticus genes expressed during inoculation, together with their functional annotations. This will help to elucidate the molecular basis of the resistance process and identify genes and chemicals that could help to inhibit the pathogen.

کلیدواژه‌ها [English]

• Candidatus Leiberibacter asiaticus
• cDNA-AFLP
• Citrus grandis
• Citrus greening